1566 yılında Osmanlı mimarlık tarihinin “zirve” ismi kabul edilen Mimar Sinan’ın öğrencisi Mimar Hayrettin tarafından Bosna Hersek’te inşa edilen köprü, 1993’te Hırvat topçu birliklerince yıkıldı.
Tarihi köprü, 20 yıl önce gerçekleştirilen restorasyon çalışmalarının tamamlanmasının ardından düzenlenen törenle tekrar hizmete açıldı. Köprü, Bosna Hersek’teki savaş sırasında saldırıya uğrayarak 1993 yılında nehrin sularına gömüldü.
Evliya Çelebi’nin “benzersiz” olarak nitelendirdiği Mostar Köprüsü’nün yeniden inşası, Türk İşbirliği ve Koordinasyon Ajansı (TİKA), UNESCO, İslam Tarih, Sanat ve Kültür Araştırma Merkezi ile Dünya Bankası’nın desteğiyle 1997 yılında başladı.
Köprü, Macar ordusunun dalgıçları tarafından orijinal taşları nehir yatağından çıkarılmasının ardından, dönemin İngiltere Veliaht Prensi Charles tarafından 23 Temmuz 2004’te yeniden açıldı. 2005 yılında UNESCO tarafından “Dünya Miras Listesi”ne alındı.
Köprü, yüzyıllar boyunca Bosna Hersek’te hoşgörü ve kültürel çeşitliliğin sembolü olarak varlığını sürdürmüştür. Yeniden inşa sürecinde tüm etnik grupların işbirliği yapması, köprüyü birleştirici bir sembol haline getirmiştir.
